De grootste verschil tussen CRISPR en Cas9 is dat: CRISPR maakt deel uit van een bacterieel afweersysteem dat bestaat uit korte palindroomsequenties, terwijl Cas9 een endonuclease is dat wordt geproduceerd door het CRISPR-systeem dat fungeert als moleculaire schaar. CRISPR staat voor Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, terwijl Cas staat voor CRISPR-geassocieerd eiwit 9. De korte palindromische herhalingen produceren CRISPR-RNA (crRNA) dat specifiek is voor de doelsequentie. Cas9 knipt de door het crRNA gespecificeerde DNA-sequentie.

CRISPR en Cas9 zijn twee componenten van het CRISPR/Cas9-systeem, een belangrijk onderdeel van het immuunsysteem van bacteriën, dat zich verdedigt tegen binnendringend virus. Op dit moment is het CRISPR/Cas9-systeem een ​​van de snellere, goedkopere en nauwkeurigere tools voor genoombewerking met een breed scala aan toepassingen.

Belangrijkste gebieden die worden gedekt

1. Wat is CRISPR - Definitie, structuur, genoombewerking 2. Wat is Cas9 - Definitie, feiten, genoombewerking 3. Wat zijn de overeenkomsten tussen CRISPR en Cas9 – Overzicht van gemeenschappelijke functies 4. Wat is het verschil tussen CRISPR en Cas9? – Vergelijking van de belangrijkste verschillen

Sleutelbegrippen

Cas9, CRISPR, CRISPR/Cas9, crRNA, Genoombewerking

Wat is CRISPR

CRISPR (Cglanzend Rregelmatig linterspaced Short Palindroom Repeats) is een eenheid van de herhalende sequentie die wordt aangetroffen in bacteriële en archaeale genomen. Het werd voor het eerst ontdekt in archaea door Francisco Mojica. De herhalende sequenties van CRISPR worden onderbroken door spacer-sequenties. Deze spacer-sequenties zijn de overblijfselen van eerdere indringers. Daarom dient het systeem als het genetische geheugen voor het detecteren en vernietigen van de binnenvallende bacteriofaag. De spacersequenties worden getranscribeerd in korte RNA-sequenties, crRNA's genaamd, die het systeem leiden om aan de specifieke doelsequenties te binden. Eenmaal gebonden aan een dergelijke sequentie, knipt een endonuclease gecodeerd door het CRISPR-systeem zoals Cas9 het gespecificeerde DNA door het uit te schakelen.

Afbeelding 1: CRISPR-systeem

CRISPER/Cas9 is een natuurlijk voorkomend genoombewerkingssysteem in bacteriën. Het wordt ook gebruikt als een hulpmiddel voor het bewerken van het genoom in het laboratorium. Wetenschappers creëren kunstmatig kleine RNA-moleculen genaamd gids RNA (gRNA) die binden aan een doelsequentie van een genoom. Zodra de doel-DNA-sequentie is afgeknipt door de activiteit van Cas9, hersynthetiseren cellulaire mechanismen het DNA. Of anders kan het verwijderde deel van het DNA worden vervangen door een ander DNA-stuk.

Wat is Cas9

Cas9 is een endonuclease dat specifiek dubbelstrengs DNA knipt. Het wordt gecodeerd door het bacteriële CRISPR-systeem. De doel-DNA-sequentie wordt gespecificeerd door het sycrRNA van het CRISPR-systeem. Door de doelsequentie te manipuleren, kan het CRISPR-systeem worden gebruikt om een ​​bepaalde DNA-sequentie in een genoom te manipuleren. Daarom wordt het CRISPR/Cas9-systeem gebruikt om genetische aandoeningen te behandelen.

Figuur 2: Rol van Cas in het CRISPR-systeem

Een ander type endonucleasen dat kan werken met het CRISPR-systeem is Cpf1.

Overeenkomsten tussen CRISPR en Cas9

Verschil tussen CRISPR en Cas9

Definitie

CRISPR verwijst naar een familie van DNA-sequenties die worden gevonden in bacteriën en archaea, terwijl Cas9 verwijst naar een RNA-geleid DNA-endonuclease geassocieerd met de CRISPR

Betekent

CRISPR staat voor geclusterde regelmatige interspace korte palindroomherhalingen, terwijl Cas staat voor CRISPR-geassocieerd eiwit.

Betekenis

CRISPR is een cluster van korte palindroomsequenties, terwijl Cas9 een endonuclease is dat wordt gecodeerd in de CRISPR.

Functie

CRISPR produceert crRNA dat specifiek bindt aan een doelsequentie, terwijl Cas9 dient als een moleculaire schaar die de door het crRNA gespecificeerde DNA-sequentie knipt.

Conclusie

CRISPR is een cluster van korte palindroomsequenties die in het bacteriële genoom worden gevonden. Het is belangrijk bij het voorkomen van de binnendringende bacteriofaag. Cas9 is een endonuclease gecodeerd door het CRISPR-systeem. Het snijdt de nucleotidesequentie af die wordt gespecificeerd door het crRNA. Het crRNA wordt geproduceerd door de transcriptie van de CRISPR-array. Het belangrijkste verschil tussen CRISPR en Cas9 is de functie van elk onderdeel in het CRISPR-systeem.

Verwijzing:

1. "Wat is CRISPR-Cas9?" Feiten, The Public Engagement Team op de Wellcome Genome Campus, 19 december 2016, hier beschikbaar

Afbeelding met dank aan:

1. "crRNA-Cas9" door marius walter - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia2. "Crispr" door James atmos - Eigen werk (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia