Wat is het verschil tussen voorwaartse en achterwaartse primers?
Inhoudsopgave:
- Wat zijn voorwaartse primers
- Wat zijn omgekeerde primers?
- Overeenkomsten tussen voorwaartse en achterwaartse primers
- Verschil tussen voorwaartse en achterwaartse primers
De grootste verschil tussen voorwaartse en achterwaartse primers is dat: voorwaartse primers hechten aan de antisense streng van het dubbelstrengs DNA, die van de 3'- naar 5'-richting loopt, terwijl omgekeerde primers hechten aan de sense-streng van het dubbelstrengs DNA, die van de 5'- naar 3'-richting loopt. Verder verwijzen 5'-primers naar voorwaartse primers, terwijl 3'-primers verwijzen naar omgekeerde primers.
Voorwaartse en achterwaartse primers zijn de twee soorten primers die worden gebruikt in de PCR (polymerasekettingreactie) om een specifiek deel van een DNA-streng te amplificeren.
3′ Primers, 5′ Primers, Antisense Strand, Forward Primers, PCR, Reverse Primers, Sense Strand
Wat zijn voorwaartse primers
Voorwaartse primers zijn een van de twee soorten primers die worden gebruikt in een PCR-opstelling. Het belangrijkste significante kenmerk van voorwaartse primers is dat ze hechten aan de antisense- of (-) streng van het dubbelstrengs DNA. In het algemeen dient de antisense-streng als de matrijsstreng voor de synthese van mRNA. Daarom is deze streng ook bekend als de coderende streng.
Figuur 1: Primergloeien
De belangrijkste functie van de voorwaartse primers is echter het amplificeren van de antisense strengen tijdens PCR.
Wat zijn omgekeerde primers?
Omgekeerde primers zijn het tweede type primers dat wordt gebruikt in de PCR-opstelling. Ze hechten aan de sense of de (+) streng van het dubbelstrengs DNA. De sense-streng is complementair aan de template-streng en staat daarom bekend als de anticoderende streng.
Figuur 2: Primer-functie
Overeenkomsten tussen voorwaartse en achterwaartse primers
Verschil tussen voorwaartse en achterwaartse primers
Definitie
Voorwaartse primers verwijzen naar de PCR-primers, die complementair zijn aan de antisense-streng van dubbelstrengs DNA, terwijl omgekeerde primers verwijzen naar de PCR-primers, die complementair zijn aan de sense-streng van het dubbelstrengs DNA. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen voorwaartse en achterwaartse primers.
Ook gekend als
5'-primers verwijzen naar voorwaartse primers, terwijl 3'-primers verwijzen naar omgekeerde primers.
Functie
Voorval
Een ander verschil tussen voorwaartse en achterwaartse primers is dat voorwaartse primers voorkomen aan het 5'-uiteinde van het PCR-product, terwijl omgekeerde primers voorkomen aan het 3'-uiteinde van het PCR-product.
Conclusie
Voorwaartse primers zijn een van de twee primers die in de PCR worden gebruikt. Bovendien hechten ze aan de antisense-streng van DNA. Omgekeerde primers zijn daarentegen het tweede type primers dat in PCR wordt gebruikt. Ze hechten aan de sense-streng van DNA. De belangrijkste functie ervan is het versterken van een specifiek stukje DNA. Het belangrijkste verschil tussen voorwaartse en achterwaartse primers is echter het type DNA-streng waaraan ze hechten.
Referenties:
1. "Polymerasekettingreactie (PCR)." Diamantina Institute, de Universiteit van Queensland, 9 februari 2018, hier beschikbaar.
Afbeelding met dank aan:
1. "Primers RevComp Melted2" door Richard Wheeler (Zephyris) - Eigen werk (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 2. "Primers RevComp Elongation2" door Richard Wheeler (Zephyris) - Eigen werk (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia